Детерминация гомологичных фрагментов в структуре белков вирусов гриппа А(Н1N1) pdm09 2009 и 2016 годов выделения и белков системы гемостаза человека

УДК 576.832.1:616.90-092

  • Ирина Николаевна Жилинская ФГБУ "Научно-исследовательский институт гриппа" Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург, Россия
  • А. В. Фадеев ФГБУ "Научно-исследовательский институт гриппа" Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург, Россия
  • А. А. Азаренок ФГБУ "Научно-исследовательский институт гриппа" Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург, Россия
  • А. Р. Прочуханова ФГБУ "Научно-исследовательский институт гриппа" Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург, Россия
  • Е. П. Харченко ФГБУН "Институт эволюционной физиологии и биохимии имени И.М. Сеченова" РАН; Санкт-Петербург, Россия
Ключевые слова: вирус гриппа, вирус Эбола, белки, гемостаз

Аннотация

Проведен компьютерный поиск и сравнительный анализ гомологичных фрагментов белков вирусов гриппа А(Н1N1) pdm09 2009 и 2016 годов выделения и белков системы гемостаза. В структуре белков вируса гриппа 2016 года выявлено 10 новых и дополнительных гомологичных фрагментов аминокислотной последовательности при отсутствии двух ранее выявленных в вирусе 2009 года фрагментов. Можно сделать вывод об усилении гомологии с белками гемостаза в структуре вируса гриппа 2016 года по сравнению с вирусом 2009 года; особенно это касается факторов коагуляции V (в НА и NS1), VIII (в РВ2), ХI (в NS1) и фактора Виллебранда (в NА). Появление у выделенного в эпидемию 2016 года в России вируса гриппа мутаций в генах, кодирующих внутренние и поверхностные белки, усиливающих мимикрию с белками системы гемостаза человека, возможно способствовало сохранению высокого уровня вирулентности, сопоставимого с уровнем вирулентности вируса гриппа, выделенного в 2009–2011 годах.

Биография автора

Ирина Николаевна Жилинская , ФГБУ "Научно-исследовательский институт гриппа" Министерства здравоохранения Российской Федерации, Санкт-Петербург, Россия

Жилинская Ирина Николаевна — д.б.н., в.н.с. лаборатории молекулярной вирусологии и генной инженерии ФГБУ «НИИ гриппа» МЗ РФ.

Адрес: Россия, 197376, Санкт-Петербург, ул. профессора Попова, д.15/17.

E-mail: irina@influenza.spb.ru

Литература


  1. Mossad S. The resurgence of swine-origin influenza
    A(H1N1) // Clev. Clin. J. Med. — 2009. — Vol. 76, № 6. —
    P. 337–343.

  2. Лузина Е. В., Ларева Н. В., Гончарова М. А. Клиникопатолого-анатомические сопоставления при гриппе
    А(H1N1) // Клиническая медицина. — 2011. — Т. 89,
    № 4. — С. 64–67.

  3. Жилинская И. Н., Азаренок А. А., Ильинская Е. В. и др.
    Репродукция вируса гриппа в клетках эндотелия кровеносных сосудов человека // Вопросы вирусологии. —
    2012. — Т. 57, № 2. — С. 20–23.

  4. Азаренок А. А., Ляпина Л. А., Оберган Т. Ю. и др. Изменение активности тканевого активатора плазминогена клеток эндотелия под воздействием вируса гриппа
    типа А и его поверхностных белков // Тромбоз, гемостаз, реология. — 2014. — № 1 (57). — С. 3–8.

  5. Komissarov A., Fadeev A., Petrov S. et al. Rapid spread of
    influenza A(H1N1) pdm09 viruses with a new set of specific mutations in the internal genes in the beginning of
    2015/2016 epidemic season in Moscow and Saint-Petersburg
    (Russian Federation) // Influenza and other Res. Viruses. — 2016. — PubDate: 2016—03—19Т04:50:34.278286—
    05 (doi: 10.1111/irv.12389).

  6. Influenza Update № 260 // WHO Influenza update. —
    04 April 2016, based on data up to 20 March, 2016.

  7. Zhou B., Donnelly M. E., Scholes D.T et al. Single-reaction genomic amplification accelerates sequencing and
    vaccine production for classical and Swine origin human
    influenza A viruses // J. Virol. — 2009. — Vol. 83, № 19. —
    P. 10309–10313.

  8. Antoniak S., Mackman N. Multiple roles of the coagulation protease cascade during virus infection // Blood. —
    2014. — Vol. 123, № 17. — P. 2605–2613.

  9. Heutinck K. M., ten Berge I. J., Hack C. E. et al. Serine proteases of the human immune system in health and disease //
    Mol. Immunol. — 2010. — Vol. 47, № 11. — P. 1943–1955.
    10. Nhu Q. M., Shirey K., Teijaro J. R. et al. Novel signaling
    interactions between proteinase-activated receptor 2 and
    Toll-like receptors in vitro and in vivo // Mucosal. Immunol. — 2010. — Vol. 3, № 1. — P. 29–39.

  10. Weiler H. Regulation of inflammation by the protein C
    system // Crit. Care. Med. — 2010. — Vol. 38 (Suppl 2). —
    S18—25.

  11. Key N. S., Vercellotti G. M., Winkelmann J. C. et al. Infection of vascular endothelial cells with herpes simplex virus
    enhances tissue factor activity and reduces thrombomodulin expression // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1990. —
    Vol. 87, № 18. — P. 7095–7099.

  12. Geisbert T. W., Young H. A., Jahrling P. B. et al. Mechanisms underlying coagulation abnormalities in ebola hemorrhagic fever: overexpression of tissue factor in primate
    monocytes/macrophages is a key event // J. Infect. Dis. —
    2003. — Vol. 188, № 11. — P. 1618–1629.

  13. Geisbert T. W., Hensley L. E., Jahrling P. B. et al. Treatment of Ebola virus infection with a recombinant inhibitor of factor VIIa/tissue factor: a study in rhesus monkeys
    // Lancet. — 2003. — Vol. 362, № 9400. — P. 1953–1958.

  14. Sutherland M. R., Ruf W., Pryzdial E. L. Tissue factor and
    glycoprotein C on herpes simplex virus type 1 are protease-activated receptor 2 cofactors that enhance infection // Blood. — 2012. — Vol. 119, № 15. — P. 3638–3645.

  15. Xu Z., Qiu Q., Tian J. et al. Coagulation factor X shields
    adenovirus type 5 from attack by natural antibodies and
    complement // Nat. Med. — 2013. — Vol. 19, № 4. —
    P. 452–457.

  16. Doronin K., Flatt J. W., Di Paolo N. C. et al. Coagulation
    factor X activates innate immunity to human species C
    adenovirus // Science. — 2012. — Vol. 338, № 6108. —
    P. 795–798.

  17. Schouten M., van der Sluijs K. F., Roelofs J. J.Т.Н. et al.
    Factor V Leiden mutation does not affect coagulopathy
    or outcome in lethal H1N1 influenza // Eur. Respir. J. —
    2010. — Vol. 36, № 6. — P. 1346–1354.

  18. Takeuchi O., Akira S. Pattern recognition receptors and
    inflammation // Cell. — 2010. — Vol. 140, № 6. — P. 805—
    820.

Ключевые слова

вирус гриппа, вирус Эбола, белки, гемостаз

Опубликован
2017-04-01
Раздел
Оригинальные исследования